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一、搞好环境卫生
在用药防治球虫病的同时，要保持良好的环境卫生。
1、清洁鸡舍
鸡舍要每天打扫，保持清洁干燥，受潮垫料要及时更换。水槽、食槽、鸡笼等用具都应定期彻底清扫冲洗，墙壁、地面使用20 %生石灰水或2%来苏儿进行消毒，饲养管理人员出入鸡舍应更换鞋子，减少和杀灭鸡舍环境中的球虫卵囊和阻止其孢子发育，这对降低球虫病的发病具有重要意义。
2、处理粪便
通常球虫卵囊随粪便排出后，在一定条件下需1~3日才能发育成有感染性的孢子卵囊，因此，鸡场中的粪便要在当天或次日打扫清除，运到远处进行堆积发酵处理，利用发酵产生的热和氨气杀死卵囊，防止饲料和饮水被污染。
二、分群饲养
因成年鸡带虫无明显症状，且不断向外排出球虫卵囊，增加了幼鸡感染球虫病的可能，因此，要坚持幼鸡与成鸡分开饲养。另外，对于不同批次的雏鸡也要严禁混养，最好实行全进全出制度以切断传染源。在饲养期间，每天注意雏鸡食欲、精神、排便情况，有病及时隔离治疗，治愈的鸡不能再重新入群。
三、发现及时
初期血粪往往看不到，等到大量的血粪出现时，病情已经严重。因此，在血粪出现之前，能判断球虫病即将发生就显得特别重要。从以下3个方面可以预测球虫病的发生：
1、球虫病出现的前1、2天采食量明显增多。饲养者在饲养中要认真观察，并记录每天的采食量。
2、一部分鸡排的粪便水分偏多，少量鸡伴有白色的粪便。
3、脱落的羽毛比正常多，出现这些现象时就要开始用药。
四、药物防治
针对目前发病日龄有所提前，所以应提早预防，从7~9日龄就开始在饲料或饮水中按时、按量投入药物。
1、由于鸡球虫很容易产生耐药性，因此对于球虫药的选择，不管是预防还是治疗，均应有计划更换药物品种，最好选用新药，这样可避免或减缓耐药性虫株的产生，从而提高药物疗效，降低球虫病造成的危害。
2、目前市场上出售的饲料、饲料添加剂中一般都含有抗球虫药，在使用时要小心用药，以免重复用药引起药物中毒，造成不必要的损失。
3、不能看到病症减轻就停药，这样达不到彻底治疗目的，反而会导致耐药性虫株的出现而影响以后球虫病的治疗效果。
4、鸡发生球虫病时食欲减退，但饮欲增强，因此治疗球虫病时最好选用水溶性抗球虫药，通过饮水途径给药。
