荧光原位杂交技术 荧光原位杂交技术fish
FISH有直接法和间接法两种。直接法是用已知碱基序列的特异DNA片段作为探针,并标记上不同荧光素,在组织切片、间期细胞及染色体标本上与靶核酸进行DNA-DNA原位杂交。因所形成的杂交体带有荧光素。故可在荧光显微镜下直接观察。常用的荧光素有异硫氰酸荧光素(FITC)、得克萨斯红(Texasred)、罗丹明(rhodamine)及其衍生物四甲基异硫氰酸罗丹明(tetramethyl rhodamine isothiocyanate,TRIT)等。该方法简单快捷,但信号较弱.敏感性较低。间接法使用非荧光物质标记的探针。如生物素或地高辛等标记探针,再通过亲和连接或免疫反应带人荧光物质来检测杂交体的存在。因为有杂交信号放大作用,从而增加了杂交的敏感性。也降低了实验成本。故间接法FISH是目前使用较多的方法。
FISH实验操作与用非荧光标记探针的原位杂交基本相似。在组织 准备方面,以新鲜组织、冷冻组织样本、细胞涂片、培养细胞爬片及中期染色体等材料进行FISH的结果优于石蜡包埋组织样本的杂交效果。由于FISH是DNA-DNA原位杂交,故在杂交前的变性处理颇为重要。
近年来。在FISH技术的基础上发展起来的分子遗传学新技术不断出现,如多色FISH技术、染色质纤维荧光原位杂交(chromatin fiber FISH)和DNA纤维荧光原位杂交(DNA fiber FISH)技术等。多色FISH通过选用多种具有可分辨光谱的荧光染料与不同的探针结合(直接法),在一个染色体中期分裂象或细胞核中可呈现多种颜色标记,同时检测多种染色体异常。如许多用染色体涂片方法和G或Q显带技术无法检测或难以确定的染色体异常,通过多色FISH技术可以揭示染色体畸变,并确定畸变的来源。此外,多色FISH对于复杂的染色体核型改变。尤其是实体瘤的染色体检查具有很好的临床应用价值。多色FISH也可采用三种或三种以上不同的标记物。如生物素、地高辛和二硝基苯酚标记探针,然后用不同颜色荧光素,如FITC(绿色)、罗丹明(红色)和cascadeblue(蓝色)标记抗体进行检测(间接法),可同时得到多种不同颜色的荧光信号,这种方法可以在同一标本上同时检测多种DNA序列。
纤维FISH技术是将细胞的全部DNA在玻片上制备出高度伸展的染色质DNA纤维,然后用标记不同颜色荧光物质的探针与DNA纤维进行杂交,最后用荧光显微镜观察结果并分析,若配合计算机图像分析软件使用,结果会更理想。纤维FISH技术可以快速直接目视判断探针位置以及多个探针间的相对位置、物理位置和重叠程度等,因而大大加速了基因定位和人类基因组高分辨物理图谱的绘制。
PRINS技术是将PCR和FISH技术联合使用,先由寡核苷酸引物或变性DNA片段与细胞内的靶DNA互补序列复性。在聚合酶的作用下,将荧光标记的脱氧核苷酸(如FITC―1l―dUTP)带人新合成的DNA中。PRINS技术可用于检测罕见的异染色质变异体和评价肿瘤细胞株的染色体异质性。
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