爱华网下面是人类基因组多样性项目(HGDP)论文中给出O3-M117原始Y-STR数据和谱系树：
（点击可放大）
其中最后一例北方汉族1290样本，根据其STR值，判断其仍然是O3-M117，这样HGDP给出M117的最近共祖时间在1.1万年左右。上图中谱系树中下面刻度每一格代表1000年。我在2012年6月份的时候初步判断O3-M117可以分成“三大簇”（参考：O3-M117谜底揭开？）。现在根据HGDP的谱系树看，我这个判断是基本正确的，只不过应该叫三大类更合适。
1 第一类
以Y-STRDYS437=14和DYS439=11为平均中心值。根据之前的数据，我判断这可能是南方类簇中的大簇，其分布于汉族刘姓，和哈尼族，少量分布于韩国。而根据HGDP的数据和谱系树看，该类确实在南方汉族中存在多样，但也存在于彝族、土家族、柬埔寨和呼盟蒙古族中。而且该类最近共祖时间在2000年，其中土家族和柬埔寨样本所代表的分支最近共祖时间500年，南方汉族0815和呼盟蒙古族1229样本所代表的分支最近共祖时间小于1000年。该簇广泛分布于中国南方以及蒙古族中。
2 第二类
以Y-STRDYS437=15和DYS439=12为平均中心值。根据之前的数据，判断是以东北-朝鲜为核心，该簇占到韩国人5.3%，广泛分布于汉族，北亚和中亚，甚至印度。而根据HGDP数据和谱系树看，该类也分布于南方汉族和土家族中，其最近共祖时间约在2800年左右。
3 第三类
以Y-STRDYS437=15和DYS439=13为平均中心值。根据之前数据判断，该类主要分布于中亚和北亚、俄罗斯，以及中国少姓轩等中，表现出中亚和北亚来源特征。根据HGDP数据和谱系树看，该类存在于呼盟蒙古族、北方汉族、赫哲族、纳西族等样本的远古分支中。其共祖时间可以追溯到1.1万年。
从以上三大类HGDP O3-M117 STR数据和谱系树看，基本可以解开O3-M117的发展史。
