目前胶原蛋白来源有猪皮、牛皮、鱼皮等。一般现在较好的生产工艺都是采用酶解，也有用酸水解，但这就完全破坏了胶原的结构，是不能达到功效。猪皮胶原在分子组成上与鱼胶原没有什么差别，但由于饲养动物会有动物疾病（如疯牛病、口蹄疫、瘟疫）及饲料污染（如瘦肉精、激素）的担忧，所以来源与海洋鱼类的被认为是最安全的。
猪与鱼胶原的吸收效果差异也很大，这是决定食用效果的最大差别。
从日本科学家对猪与鱼胶原蛋白，在体外模拟消化液的作用下被分解的实验可以看出，鱼胶原在体外模拟消化液的作用下分解程度很高，更多的可吸收有效成分——羟脯氨酸、脯氨酸游离出来，比猪胶原高了2.5倍，意味着在体内被吸收和利用程度会越大，而猪胶原几乎没有什么太大的变化，暗示其可能在体内的吸收效果也不好。
因此同样服用胶原蛋白，鱼胶原蛋白的效果是比较好的，而鱼胶原蛋白的原料价格也比其他动物来源的胶原蛋白要贵。
为了达到良好的效果，我们建议服用胶原蛋白时，最好是采用鱼胶原蛋白。
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