爱华网第一集
李元芳奉命追查蛇灵的下落。如燕的好朋友小梅答应帮助李元芳，但她和李元芳接头时，被刺客围攻害。临终时，小梅让李元芳快回洛阳，并对李元芳说：“闪闪寒寒。” 肖清芳派出其蛇灵第一号杀手闪灵前往洛阳刺杀武则天。盂兰盆节，武则天要到寒光寺进香，千牛卫在清查寒光寺时，发现一具无头男尸，狄仁杰勘察后认为，这是一个僧人的尸体，而寒光寺中的僧人并没减少。太子李显与修真坊一个叫小慧的女子相好。
第二集
如燕告诉狄仁杰，蛇灵还有三大杀手：闪灵、血灵、魔灵。狄仁杰分析认定，小梅弥留之际所说的“闪闪寒寒”应该是指闪灵要到寒光寺刺杀武则天。狄仁杰连夜彻查寒光寺，用智谋找到了冒充被杀僧人法能的凶手，蛇灵六大杀手之一的血灵将其杀死灭口，并将李元芳引到大雄宝殿，李元芳由此找到了藏在寺里的闪灵。一番激战，李元芳虽然制住了闪灵，闪灵还是用忍术中的遁身术逃逸。
第三集
狄仁杰直觉到，真正的刺客既不是假法能，也不是闪灵，他命令千牛卫严格戒备。李元芳追赶闪灵，发现闪灵已金蝉脱壳而逃，他情知不好，急忙赶回。武则天入寺进香，狄仁杰劝说武则天让如燕假扮进香。去而复返的闪灵躲在梁上，但他良心未泯，不愿杀死武则天，让天下大乱、生灵涂炭。不仅如此，当闪灵发现血灵要刺杀武则天时，他还发暗器救下了武则天。卫士们包围了现场，闪灵劫持了大将军桓斌，要桓斌送他出寺。狄仁杰查看现场，认识到是闪灵阻挠行刺，就自愿代替桓斌，送闪灵出寺。早已赶回寺院的李元芳制住了闪灵，狄仁杰让李元芳放走闪灵。对此，武则天勃然大怒，梁王趁机落井下石，狄仁杰沉着应对，说服了武则天让他全权处理此案。
第四集
肖清芳命属下通知小慧，抓紧时间对太子展开行动。狄仁杰推断，假法能潜入寒光寺，不是为了刺杀武则天，而是别有所图。内卫府大阁领黄胜彦率卫士押解钦犯时被袭击，全军覆没，钦犯被劫走。狄仁杰勘察现场后认定，这是蛇灵所为。
第五集
武则天听说钦犯被劫，十分恼怒和着急，但她又指示狄仁杰不要再过问此事，狄仁杰心生疑窦。狄仁杰假设，神秘钦犯被秘密关押在寒光寺中，假法能潜入寒光寺就是为了查找神秘钦犯的关押处。他带领李元芳、如燕再赴寒光寺，果然发现了假法能找到关押处后所画图画，并由此找到了秘密地牢。在地牢中，狄仁杰发现了三位僧人尸体，狄仁杰判断，他们和真法能就是负责看押的内卫，而寒光寺僧值就是负责看押的内卫首领。
第六集
武则天见狄仁杰已经接触到事实真相，再加之狄仁杰反复陈说神秘钦犯的身份对破获蛇灵案的重要性，就告诉了狄仁杰事情的原委。原来，这个神秘钦犯是原钦天监监正袁天罡。当年，袁天罡利用武则天对他的信任，建立了蛇灵组织，图谋不轨。武则天想要将其处死，但袁天罡却说十年后洛阳将发生一件异事，会危及武则天的生命，武则天遂建立寒光寺专门监押袁天罡。现在，十年之期已满，而袁天罡被救走，武则天催促狄仁杰尽快破案。太子李显去找被小慧，被蛇灵的人劫持，蛇灵派人假冒太子住进东宫。小慧让假太子通知蛇灵各坛坛主帅属下进入东宫，在后花园里挖地道通向洛水。小梅约李元芳在大杨山古庙中见面，狄仁杰从这一细节分析，蛇灵的总坛应该在大杨山，他派李元芳和如燕前去寻找。
第七集
狄仁杰到东宫叮嘱太子要谨慎从事，假太子接待了他，细心的狄仁杰发现，太子很不对劲。袁天罡和肖清芳召见闪灵，告诉他蛇灵要建立自己的天下，闪灵不愿意帮助外人夺取自己李姓天下，与蛇灵人展开激战，被血灵砍伤中毒，他杀死血灵逃脱，被前来寻找蛇灵总坛的李元芳和如燕遇见，李元芳杀死魔灵和大批蛇灵杀手，将闪灵救下。
第八集
李元芳和如燕闪灵到一个老猎户家住宿，服用了老猎户的药，闪灵的情况稍有稳定。为了给闪灵驱毒，李元芳向老猎户打听后得知，不远处有个镇甸叫陀螺地。小梅曾约李元芳到柳州青阳客店见面，狄仁杰微服到青阳客店访查，恰好碰上青阳客店发生命案，两个住宿的客人被杀。狄仁杰勘察下场，柳州刺史温开带衙役前来，觉得狄仁杰可疑，想要抓捕狄仁杰，狄仁杰与刺史分析此案。
第九集
狄仁杰查明，青阳客店里的哑巴女佣，就是死而复活的小梅，而客店老板吴祥是其死士。小梅从大杨山逃出后，蛇灵派人四处搜查，她只好藏在青阳客店躲避风头。两个追查小梅行踪的蛇灵的人到青阳客店投宿，小梅命吴祥将其杀掉。小梅告诉狄仁杰，蛇灵的总坛在大杨山的陀螺地，她愿意帮助狄仁杰铲除蛇灵。
第十集
李元芳和如燕带闪灵到陀螺地疗毒，误入蛇灵总坛，被蛇灵杀手袭击。如燕和闪灵则被俘。李元芳与一神秘杀手交战，为了弄清蛇灵总坛的入口，狄仁杰故意卖了个破绽，让神秘杀手用剑刺穿了自己身体，大家以为他已死。狄仁杰率兵拔除蛇灵哨卡，向陀螺地迫近。
第十一集
袁天罡召见建造蛇灵总坛的老仆人鲁成。当鲁成返回时，见到原认为已死的李元芳。李元芳要鲁成帮助攻打蛇灵总坛，鲁成不肯。袁天罡计算出洛河神异的准确日期后，肖清芳将袁天罡杀死，并清洗袁天罡的老部下，鲁成终于答应帮助李元芳。这时，狄仁杰也率兵到达。小梅率人在李元芳之后进入了通往总坛的密道。
第十二集
李元芳、小梅率人在密道内与蛇灵激战，狄仁杰率兵在密道外清剿，内外夹击，大破蛇灵总坛，肖清芳受重伤后逃走。
第十三集
清理现场时，发现肖清芳她被一个神秘杀手杀死，狄仁杰分析蛇灵中有第二股势力存在。该杀手还杀死了两个保护闪灵的千牛卫，重伤闪灵，随后，又第二次刺杀闪灵。为什么敌人一定要杀死闪灵，狄人杰大惑不解。在俘虏中，发现一些人装扮成了张柬之、姚崇等朝中大臣的样子，狄仁杰感觉肖清芳其志不小。当他听说还有人装扮成太子李显的样子，回想起自己上一次见李显，李显的反常表现后，狄仁杰急忙命大军返回洛阳。
第十四集
回到洛阳，狄仁戒杰听说一向喜欢出外游玩的太子两个月没有出宫，把整个后园都封闭了起来，用了两个月修建了一个荷花池，他觉得很是可疑，就以看荷池为名到东宫探看。狄仁杰发现，太子是假的，而狄春故意落入荷池后发现池塘底部有一个大方框。回想在袁天罡处发现的图纸，并询问了鲁成，狄仁杰断定，那方框是一个水闸。神秘杀手又一次企图暗杀闪灵，被如燕和小梅发现惊走。狄仁杰逮捕了假太子，从他的口中了解到蛇灵二十二堂堂主率两千名手下潜入东宫挖掘隧道，安放水闸。
第十五、十六集
狄仁杰、小梅和大将军权斌率军从密道中进入东宫营救太子、清剿乱党，却被蛇灵制住，原来，小梅和她的孪生妹妹小凤其实就是血灵，大将军权斌也是蛇灵堂主，而鲁成其实就是化妆的袁天罡本人。后来赶到的闪灵其实也衷心拥戴袁天罡，他到狄仁杰身边是做卧底，他将一起赶来营救狄仁杰的李元芳点穴击倒。袁天罡等人告诉狄仁杰，袁天罡被救出后，势力不如肖清芳，他们就设计将狄仁杰引入蛇灵总坛，利用狄仁杰的力量清除肖清芳。他们到洛阳的目的，是想借洛河潜涌，谋害武则天和朝臣，并用蛇灵部下假扮他们，从而窃夺天下。他们劝狄仁杰为他们卖命。狄仁杰痛斥蛇灵众人，他说他早就觉察了出了他们的奸计。袁天罡等人不信，狄仁杰一声动手，化妆成小梅孪生妹妹小凤的如燕刺杀了小梅，李元芳也从地上站了起来，原来他在衣服里穿有软猬甲。这时，大将军王孝杰也率大军赶到。一番激战，李元芳杀死了闪灵，蛇灵上下全被歼灭，袁天罡本人也被捕。当洛河潜涌时，已撤至安全位置的武则天和朝臣们眼看着宫殿被夷为平地，狄仁杰又一次挽救了朝廷。为了不使武则天迁都洛阳其实是被袁天罡欺骗的内幕，在狄仁杰的建议下，袁天罡被秘密赐毒酒而死。同样知悉秘密的狄仁杰，为了让武则天放心，他上书朝廷，以身体状况欠佳为由，请求带领李元芳告老还乡，武则天准奏。十里长亭，太子李显、丞相张柬之、大将军王孝杰为狄仁杰饯行。
