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百度成立时，就把股份分成了三部分：一部分为创始人持有，一部分由风险投资者持有,还有一部分是员工持有的股票期权。李彦宏透露，自己最初持股比例为50%，徐勇则为自己的1/3。百度IPO后，总股本扩大为3232万股，以此为基数，百度高管持有43.5%的股份,处于控股地位，在高管中，李彦宏个人持股22.4%，徐勇7%。李为最大的个人股东。
为了防止其他公司恶意收购（主要是GOOGLE），百度采取了所谓得牛卡计划的股权设置赴美上市。其具体实施方法是，上市后的百度股份分为A类(ClassA)、B类ClassB股票。将在美国股市新发行股票称作A类股票，在表决权中，每股为1票，而创始人股份为B类股票，其表决权为每1股为10票。在这样的股权结构下，Google在公开市场收购百度的梦想几乎无法实现。分析人士认为，从理论上讲，即使绝大部分股权均被Google收购，但只要李彦宏等创始人大股东所持的股份在11.3%以上，即可获得对公司的绝对控制权。
另据百度招股说明书披露，在上市前的上轮私募中Google实际向百度注资499万美金，仅获得2.6%的股权。除Google外，DFJ(DraperFisher Jurvetsone Planet持股为28.1%，IntegrityPartners持股为11%，Penin-sulaCapitalFund持股为10.1%，IDG持股为4.9%。李彦宏作为创始人及CEO持股为25.8%，另一位创始人徐勇则持股为8.2%，其他4位高管共持有百度3.7%的股份，另有5.5%的股份为普通员工所持。
