幽门螺旋杆菌目前的主流治法是三联疗法和四联疗法，疗程有1周或2周，一般以1周为主，最多不要超过2周（特殊病人除外）。常见的三联疗法是一种制酸药：奥美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑等都可以，加两种抗生素，一般是阿莫西林加克拉霉素，如果青霉素过敏的，可以用甲硝唑加克拉霉素，一共是三种药物，所以称为三联疗法；如果是四联疗法，就是在前三种的基础上加铋剂如丽珠得乐、果胶铋等。其实药物的选择是不绝对的，一般一种制酸药加两种抗生素的属于三联疗法，一种铋剂加一种制酸药加两种抗生素的属于四联疗法，至于如何选择制酸药，如何选择铋剂，如何选择抗生素，不同的医生可能有不同的经验，不必一定要按照我刚才介绍的情况。
幽门螺旋杆菌一般呈短棒状，当使用抗生素后，如果没有使用针对性的抗生素或抗生素没有达到剂量和疗程，它就会变成球形，这样的话对抗生素就有一定的抵抗作用了，因此，吃过抗生素的患者对幽门螺旋杆菌的测定和治疗是有影响的，建议在使用抗生素后间隔1个月的时间再进行杀幽门螺旋杆菌的治疗。
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