爱华网基因酷质粒图谱http://www.genecool.com/bbs/forum-38-1.html，收藏了将近800种质粒的图谱及相关信息
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质粒图谱信息
一.九种表达载体
Pllp-OmpA, pllp-STII, pMBP-P,pMBP-C,
pET-GST, pET-Trx, pET-His, pET-CKS, pET-DsbA
二.克隆载体
pTZ19R DNA
pUC57 DNA
PMD18T
PQE30
pUC18
pUC19
pTrcHisA
pTrxFus
pRSET-A
pRSET-B
pVAX1
PBR322
pbv220
pBluescript II KS (+)
L4440
pCAMBIA-1301
pMAL-p2X
pGD926
三.PET系列表达载体
Protein Expression » ProkaryoticExpression » pET Dsb Fusion Systems 39b and 40b
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET Expression System33b
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET ExpressionSystems
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET ExpressionSystems plus Competent Cells
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET GST FusionSystems 41 and 42
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET NusA FusionSystems 43.1 and 44
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET Vector DNA
Protein Purification » Purification Systems » Strep•Tactin Resinsand Purification Kits
四.PGEX系列表达载体
T EcoRpGEX-1 I/BAP
pGEX-2T
pGEX-2TK
pGEX-3X
pGEX-4T-1
pGEX-4T-2
pGEX-4T-3
pGEX-5X-1
pGEX-5X-2
pGEX-5X-3
pGEX-6P-1
pGEX-6P-2
pGEX-6P-3
五.PTYB system
PTYB1
PTYB2
PTYB11
PTYB12
六.真核表达载体
pCDNA3.1(-)
pCDNA3.1(+)
pPICZ alpha A
pGAPZαA
PYES2.0
pBI121
pEGFP-N1
pEGFP-C1
pPIC9K
pPIC3.5K
如何阅读分析质粒图谱
载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种非病毒转基因载体。
一、质粒的组成要素
复制起始位点Ori:即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。
抗生素抗性基因:可以便于加以检测，如Amp+,Kan+
多克隆位点MCS:克隆携带外源基因片段
P/E:启动子/增强子
Terms:终止信号
加poly（A）信号:可以起到稳定mRNA作用
二、如何阅读质粒图谱
第一步：首先看Ori的位置，了解质粒的类型（原核/真核/穿梭质粒）
第二步：再看筛选标记，如抗性，决定使用什么筛选标记。
（1）Ampr 水解β－内酰胺环，解除氨苄的毒性。
（2）tetr 可以阻止四环素进入细胞。
（3）camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物，使之失去毒性。
（4）neor（kanr） 氨基糖苷磷酸转移酶 使G418（长那霉素衍生物）失活
（5）hygr 使潮霉素β失活。
第三步：看多克隆位点（MCS）。它具有多个限制酶的单一切点。便于外源基因的插入。如果在这些位点外有外源基因的插入，会导致某种标志基因的失活，而便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。
第四步：再看外源DNA插入片段大小。质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。一般来说，外源DNA片段越长，越难插入，越不稳定，转化效率越低。
第五步：是否含有表达系统元件，即启动子－核糖体结合位点－克隆位点－转录终止信号。这是用来区别克隆载体与表达载体。克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。选用那种载体，还是要以实验目的为准绳。
启动子－核糖体结合位点－克隆位点－转录终止信号
启动子－促进DNA转录的DNA顺序，这个DNA区域常在基因或操纵子编码顺序的上游，是DNA分子上可以与RNApol特异性结合并使之开始转录的部位，但启动子本身不被转录。
增强子/沉默子－为真核基因组（包括真核病毒基因组）中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。其作用与增强子所在的位置或方向无关。即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。/沉默子－负增强子，负调控序列。
核糖体结合位点/起始密码/SD序列（Rbs/AGU/SDs）：mRNA有核糖体的两个结合位点，对于原核而言是AUG（起始密码）和SD序列。
转录终 止顺序（终止子）/翻译终止密码子：结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列，此位点down－stream有一段GT或T富丰区，这2部分共同构成poly（A）加尾信号。结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列，此位点down－stream有一段GT或T富丰区，这2部分共同构成poly（A）加尾信号。
