爱华网油绿的麦田中莲见雄一依然孤独，听着莉莉周音乐的他四顾，眼神迷茫。
星野修介站在黄昏的稻田中，听着莉莉周音乐，突然地他撕吼起来。嘈杂的音乐渗入进四周窒息的空气之中，淹没了他的撕吼。星野，莲见，不同的时间，站立在同一片麦田，被时间阻隔，被心灵阻隔。只有莉莉周的音乐，在天空下回响着，熟悉又陌生。交流，依然困难。
在《关于莉莉周的一切》中，孤独是一种人与人之间的疏理。影片所讨论的是一群日本的边缘少年。影片开头画外音，电脑字幕打出“她生于1980年12月8日22时50分。那一天和玛古被杀的日子完全吻合。可是对于我来说，这偶然的事没有意义。对我来说重要的，那天，那时，她诞生的事。她的名字叫，莉莉周。天才。根据这些，宇宙，以太体现者。”思想得到解放，她那样做，莉莉周闯进以太当中的身影，继续发展为波长，超越可见度达到更加透明更加深的领域。有浸透性痛苦的映像，充满所有的空间。”“我的痛苦要以太治疗。”“对于我有重要的东西，朋友、家人、恋人，可是这些都会带来很多的伤害，大家都忍耐着生存，正因为如此有以太，便宜和永远的居所，那是以太。”“莉莉周可能会看见吧，大家看不见的是什么呢，如果是以太的话，只有听莉莉周。”“这里加入音乐，除了莉莉周还有谁呢？”“真正的以太只存在于莉莉周那里。”“我选择以太的人，作为莉莉周守护的人。选择的人必须付出全部的使命，再次有愚蠢的人犯过错，遵从以太的指导。”“这不是有点宗教吗，如果大家没有以太就不能生存下去吗？”“这样的话只是说说而已，感觉不到莉莉周有以太的存在，是不是感觉我很怪？”“看，和其他人都一样，莉莉周会想到谁”“可能是吧，听着曲子也完全感受不到，大概大家都被她洗脑过吧”“大家的这么说，以太是什么？”
镜头闪回。“1999年，13岁，比喻成颜色的话是玫瑰色。”一年前的那时候星野和莲见，同在剑道部社团，是很要好的朋友。他们经常一起聊天，吃拉面，谈论兴趣爱好。在别人的眼里星野是出色的，作为一年级的入学代表他足以引人注目；甚至在有些女生眼中他是个自以为是的家伙。但是在他表象的强势之下，谁都没有注意到他内心的空虚与无助。在莲见在他家中留宿的那个晚上，他向莲见吐露道“大家都误会我说的话了，我并不是很聪明的。我考试只取得了第七名，说我得了第一名是谎言。谣言是很可怕的。我只是说在性格测试中取得了第一名，这也没什么了不起的。结果大家都不明白我的事。”（后面最重要的几句没听懂）这种看似不经意的闲聊，其实正是星野真实内心的写照。他太好强了，不愿意让人看到他软弱的一面。他之所以没有对谣言进行辩解，可能是希望在别人面前是强者，使内心软弱的自己不受到伤害吧。他向莲见袒露心扉，正是他渴望被人了解，也是他对莲见信任的表现。可惜，那时的莲见实在太单纯了。在莲见看来，星野优秀聪明，家里又有一个这么年轻美丽的妈妈，星野比起自己应该是一个更为幸运和幸福的人了。对于星野真实的家庭背景一无所知的他来说，要去了解星野的内心实在太难了，何况他自身还自顾不暇。
影片对星野家庭的介绍是通过第三者神崎望着荒原上的那个早已废弃的纺织工厂对莲见说道，“你知道吗，这里原来是星野家的工厂。后来破产了，家人也离散了。”家庭破裂，之后和母亲外婆一起搬进一个破落的老式公寓居住，父亲又不知所踪。对于一个正处于青春期的少年，这种打击是巨大的。星野虽然在朋友、家人面前表现得很平静，但他的内心真的可以平静吗？他刻意的压制内心的矛盾，这样只能使自己变得更加迷茫与不安。面对这种困扰，他无法向家人倾诉。在莲见去星野家拜访的那一段中，会发现两母子之间几乎没有什么交流。倒是莲见与星野的母亲之间很谈的来。莲见与星野谈起他的母亲时，星野也刻意的避开话题。还会注意到一个小细节就是，星野在不多的几次提及母亲时都没有用到敬语。在家庭中，他和母亲已经开始有了隔阂。他也无法向朋友表述，或许朋友对他的意义仅仅限于玩伴而已，就算说了他们可能也不会理解。唯一能给星野安慰只有莉莉周的音乐还有讨论关于莉莉周一切的网络世界。“开始，叫青猫。有这样的见解，至今还不明白，莉莉周的爱好者请多指教。”“开始了青猫先生，这是为了爱莉莉周读者们的以太的岩。我是管理人非丽亚，加入这里的条件是喜欢莉莉周的事。仅仅是这样而已。所以，不要担心，对于莉莉周的热情与幻想，请你一个个写在这里。”网络，躲藏在屏幕背后，黑暗的、安全的地方，看不到彼此的表情，只有真实的心灵通过小小的键盘在相互触碰。
冲绳之旅成了星野人生的转折点。他先是在夜晚的沙滩上遇到金枪鱼的袭击，差点死去。之后，又险些溺水丧命。阿拉古斯古，神秘又飘忽的曲子。它同时又是一个岛的名字，在海的对面，非常美丽的一个岛屿。星野站在水的中央，阿拉古斯古那缥缈又神秘的旋律在耳边飘荡、回响，渐渐地在空气中沉淀。在神秘的旋律中，星野刹那间似乎找到了似曾相似的莉莉周，莉莉周的身影似乎就在阿拉古斯古的曲子中飘荡。飘浮，飘浮，在澄清的水中肆意前行；下坠，下坠，随着幻影脱离尘世……镜头晃动。死亡是一种解脱的方式，星野没有挣扎，顺着海他下沉了下去，这也许是天意。上天的安排，于是他迎向阿拉古斯古、迎向莉莉周、迎向死亡、迎向天堂。可是，他被救了，在不知不觉中他又回到了岸边。“你不要紧吧。”和他们同行的游客发现了星野，在经过游客和导游的紧急抢救下，星野又活了过来。但在归途中，与他们通行并救了他的游客却发生了意外，倒在了血泊之中。在旅途中的这连串意外和打击，从此彻底改变了星野的人生观。电脑字幕打出“1999年夏天，预言不实现，如果地球毁灭的话。就像那暑假那样，如果人生结束的话，可能是幸运的。——非丽亚。”“毁灭，人类。现在留下我们的世界，太可笑了。——青猫。”在星野的世界中，活着是一种折磨，孤独像幽灵一样每天都在啃食着他的灵魂，只有死亡才是终极的解脱。但是，经历了两次死亡之后，他却侥幸的活了下来。而不该死的同行者却发生了意外。原来命运是这么的荒谬，想解脱的得不到解脱；不想死的，神却可以轻易的将他带走。在星野看来，世界留下的只是一片绝望。在绝望中，人，是可以变成任何东西的！因为人性已经灭绝！在归途的船上，星野一把将所有剩下的钞票仍向天空，落进海里。在同伴地尖叫声中，星野笑了，笑得如此诡异。那个笑容是危险信号的预示。
新学期的第一天，从这一天起世界变成了灰色。当看到同班流氓犬伏欺负同学眷井的暴力行为，星野体内的凶狠本性被这种暴力所激发了。他一脚把蹲在桌子上的犬伏连同桌子一起踢翻在地，在尖叫声中只见他手中握着一把刀。面对同学对他的喝阻，他露出了迷茫的表情，并继续拿起椅子砸向犬伏。四周一片寂静，这时阿拉古斯古的曲子又在星野的脑海中响起，情景是如此的诡异。星野拿着刀，慢慢走向犬伏，割下了他的一撮头发，然后在众目睽睽之下走出教室。迷茫？麻木？星野那时的表情令我琢磨不透，就如完全被脑中的阿拉古斯古所控制一样。他开始明白，原来毁灭是如此轻而易举，人性的改变是如此轻而易举。或许做一个恶魔比起平日在众人面前的优等生来得更容易，更能够感受到自身的真实存在。作为过去优等生的自己是孤独的，那么就做个恶魔，让自己彻底陷入孤独，彻底的毁灭。让人去憎恨、让人去害怕、让人去厌恶。既然别人无法理解我的痛苦，那么我就让他们感受和我同样的痛苦，和我一同去体会彻底的绝望吧！也许这就是星野当时的心情，无助的呐喊只能用破坏和暴力的方式去发泄。犬伏退学了，当老师向全班同学这消息时，星野一脸的无所谓。在他看来，这种人渣早就该被处理掉了，而老师却让全班同学反省。他指使同学把犬伏的头像画在纸上，然后他在头像上面画了两道叉，并在旁边注明“处刑”。这种对老师公开的挑衅行为，宣告着他从此以后将与众人眼中的优等生彻底划清界限。
“公元2000年，14岁。只有田园的绿，很耀眼。——非丽亚。”莲见，孤独的站在绿色的麦田里。现在，再也没有星野了，这个曾经最要好的朋友。陪伴他的只有莉莉周。他无法理解，星野从冲绳回来之后的变化。或许他从没有打算去了解真正的星野。朋友也许只等同于玩伴，在少年人的心理，朋友很简单，无须去了解其背后的意义。莲见也是孤独的，母亲和父亲离异后，带着他再婚。婚后不久，又有了一个异父的弟弟。在家里他很沉闷，很少和这个弟弟说话。那次，在莲见与星野妈妈的谈话中，妈妈问道：“有弟弟吗？”“没有。”回答地非常直接，可以看出莲见对这个弟弟是排斥的。继父对莲见很客气，仅仅是客气，这与关爱是不同的。有时客气更令人觉得不自然。现在，母亲又即将分娩，对于长子莲见的关心也变得更少了。莲见的心中，母亲也许早已忽视了自己的存在。母亲把他的沉闷、压抑看作是老实，听话。当在老师面前听说自己的孩子偷了东西，不问清缘由，劈头盖脸地就是一顿责打。莲见很晚偷偷地溜出去，她也不知道。除了物质上的照顾，她对孩子的其它一无所知，也无暇顾及。父母们有时真的很奇怪，他们能够关注到电视上对少年犯罪的报道，津津乐道的在一旁评头论足，而对自己身边的孩子，投入的关心却是那么的吝啬。画外音，字幕打出“呼吸的第一曲，多比丝创造，阿拉古斯古，莉莉周说。第一个把以太加入音乐的人，多比丝和艾礼古。可是不能误解了，莉莉周的以太并不受谁的影响。知道多比丝以前，因为莉莉周是以太的觉悟者。——非丽亚。”当发现莲见偷东西时，相对于母亲的愤怒，老师表现得只是无奈，“这个阶段的孩子，莲见也是其中的一个，他们在想什么，我们也不知道。”程序化地家长接见，公式化地教导与劝慰，什么都没有解决，一切只是形式而已。字幕继续打出“在黑暗的房子里，总是在画着，想说地只是这样，莉莉周说。
散场了，人群从演唱会的各个出口涌出，莲见在等待着，等待着星野的出现。星野若无其事的走来“还在这里等啊，没有人叫吗？”“再见。”星野从莲见的身边走过，莲见望着星野渐行渐远的身影，他知道如果今夜让星野就这样走了的话，自己将再也没有勇气去与他抗争，只有今夜！人群依然在缓缓流动，勇气，要找到勇气。呼吸，呼吸！试着喊出声来！“啊——！啊——！啊——!”莲见用尽全力声嘶力竭地拼命喊道：“是莉莉周！莉莉周啊！莉莉周在那里！”“在哪里？”“招着手，是莉莉周。”“人群拥挤着，向着莲见叫喊的方向涌去。星野也随着人群在找寻，找寻心目中的那个莉莉周。莲见排开人群在靠近他，但他全然不知。他一点一点地在靠近，在靠近，终于…终于……，星野的背后站着莲见，他浑然不知。时间，在这一刻变得缓慢，镇痛，刹那地镇痛，冷不防地镇痛从背后袭来，星野转过身看见莲见，莲见的表情是那么的平静，没有任何表情，然后擦身而过。星野倒下了，倒在了人群之中，没有任何地挣扎。死亡对他来说是一种解脱，他安静的接受，想安静的消失。人群由欢呼声转为尖叫：“救护车，救护车！”拥挤——推桑——12月28号，星野，在这天消失。莲见在夜色中，从口袋中掏出匕首，匕首上沾满了血，是星野的血，插在那只青苹果上。“那天，又失去了一个魂魄，一个少年死去了。是谁杀了少年呢，是谁玷污了以太呢。不能救回的魂，现在想起了悲惨的声音。”“那天演唱会我也去了，还没抓到犯人吗？”“因为那件事莉莉周，觉得是不吉利的人，在周刊上看到莉莉周，不能选择。”
莲见想重新开始新的生活，摆脱星野之后的新生活，他开始试着弹钢琴，因为久野弹钢琴。屋内不再是黑暗的，因为有了一道阳光照射进来。妈妈开始关心他，为他染头发，但是在家中，刚出生的弟弟更需要妈妈的照顾。青色的世界不再纯洁，被血迹所玷污。星野死后，一切看似又恢复了平静，但所造成的创伤却需要时间去愈合。“一年级时在成绩上加把劲的话，到了二三年级就容易了。虽然学习也是一样，为什么结果不是所想的一样。成绩不好，所以就慢慢没有干劲了。因为反正都要测试了，现在想出去玩的心情，那样的话成绩也就下降了。越下降越没有心情学了，这样就算了。你是这样想的吗？”“有什么烦恼的事吗？”“没有。”“是吗。那就到这里吧。”老师还是公式化的淳淳教导，现在没有什么可以烦恼的了，一切都已经结束了。琴声，多么的美妙动听，莲见安静地站在一边听久野弹琴，一道阳光照射进来，温暖了莲见，温暖了他的心灵。整个画面静止了……
