最小生成树 遗传算法 遗传算法实现排课系统 发育系统树与遗传距离的算法

如何建系统发育树和计算遗传距离:

1、 先在NCBI上找到要比较的序列,并且把序列复制到写字板中,格式如下所示:

最小生成树 遗传算法 遗传算法实现排课系统 发育系统树与遗传距离的算法

2、 打开Clustal X2软件,界面如下

点击File选择Load Sequences,选择刚才编辑好的写字板,注意写字板必须存放在英文字母的文件夹中。

3、点击Alignment中的第一项,进行各序列比对,比对结束之后,点击Output Format Option选择保存格式,点击确定。最后的格式会保存写字板所在的地方。

3、 Aln格式转换成mega格式:打开已经保存好

的这个软件,点

上面黄色标志的第二个标志,出现如下界面:接着点击Utilities,在其

下拉菜单中点击第一个选项,

出现对话框,点击OK,出现对话框,把mega格式保存起来。

4、 遗传距离和系统发育树的建立:

打开MEGA软件,点击Fild打开mega格式数据,分离点击Plylogeny和Distence建树和计算其遗传距离。


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hdu1233还是畅通公路 hdu1233

方法一(prim算法);普利姆(Prime)算法(只与顶点相关)算法描述:普利姆算法求最小生成树时候,和边数无关,只和定点的数量相关,所以适合求稠密网的最小生成树,时间复杂度为O(n*n)。算法过程:1.将一个图的顶点分为两部分,一部分是最小生成树中的结

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