爱华网太平军中有不少人是天地会成员，即便“天王”洪秀全将小刀会视为撮尔小贼，有些人还是会顾及同门之情伸出援手。比如有天地会背景的罗大纲，曾计划组织600艘皮蓬小船“冲水营直下接连上海匪徒”，但很快被天京方面调离镇江。罗大纲本人虽是参加过金田起义的元老，立下赫赫战功，1855年战死于江西九江，但因为没有加入“拜上帝会”，又是天地会成员，不被洪秀全看重，1863年太平天国只给他追封了一个令人哭笑不得的“肺王”。
在洪秀全创立“拜上帝会”之前，天地会已经在两广、闽南、长江一带颇具影响力。洪秀全为了实现他的政治目的，在发动起义直至定都前期，洪秀全都在设法吸收、利用天地会的势力。天地会秦日纲、罗大纲、苏三娘都率领一大批天地会成员参加了金田起义。
但天地会帮众甚多、势力甚广，洪秀全又不能不防。据萧一山编著的《近代秘密社会史料》，被清军俘获的太平天国“天德王”洪大全供述称，洪秀全、冯云山二人曾“在广东、广西结拜无赖等设立天地会，后来愈来愈多，恐怕人心不固”，才演绎出天兄下凡那一套，来煽动会众。
洪大全在参加太平军之前即是天地会湖南地区的首领，永安建制之初地位与洪秀全不相上下，同称“万岁”。有研究者认为，自从洪大全被俘，天地会成员在太平天国中的地位就开始下降了。太平军在永安发布的《奉天诛妖救世安民谕》中公开批评天地会成员纪律涣散、投敌叛变的行为：“查尔们壮士，多是三合会党，盍思洪门歃血，实为同心同力以灭清，未闻结义拜盟，而反北面于仇敌也”。这既是天地会在太平军中颇具影响力的旁证，也是双方关系开始恶化的一个表征。
尽管如此，天地会对太平天国的影响也不能彻底清除，在太平天国文献中仍旧大量运用了天地会的“切口”（暗语），例如：
天地会成员自称“洪家兄弟、万姓一宗”、宗旨是“灭清复明，洪氏当阳”，拜台入会时“三拜日为兄、四拜月为嫂”。《洪门总图》、《总结洪门七十二底诗》均有“洪日”一词出现，如“五色旗幅影洪日”。而洪秀全就自称为“洪日”，其妻子则称为“月宫”、“又正月宫”。
天地会把已经拜台入会的“人”称为“马”，例如广西天地会称本省人为“土马”，称广东人为“广马”，称客家人“来马”，其他地方人则为“外马”；把到处招人入伙的行为称为“拉马”，那些没有入帮的人被称为“牛崽”。在太平天国发布的“圣旨”里，就有诸如“谁能章程吊马”、“能起得马”等词语，这里的“吊马”、“起得马”，都是“调来人”的意思。
天地会将核心机密称为根机，《关圣对》：“争天夺国一点红，露出根机剑下亡”。太平天国《天兄圣旨》中有“不可命外小见，根机不可被人识透也”。
仅此冰山一角，可以窥见天地会对太平天国确有影响，但由于二者一暗一明，一黑（指秘密结社，无他意）一白（被奉为农民起义代表，有争议），加上取舍教化，导致世人多见历史画卷的波澜壮阔，忽视民间社会的静水深流了。
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