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本病属于条件致病性病原，因此非常容易在防疫密集时刻或强应激时发生，因此在一些时间点上进行控制。
1、两周龄以内
两周内特别在7日龄和14日龄左右极易发生，应严格控制温度，注意通风换气，添加敏感药物。2日龄前温度维持在35℃以上，以鸡背温度为标准，临床以10%出现张口呼吸为标准，特别在冬天非常关键，适当高温育雏可明显降低一些疾病发生率，3日龄开始递减温度，通风，换气。
温度每天递减0.5～1℃，到24℃时，不再递减。通风换气应使用排风扇，以免造成舍内温差过大。适时通风可保证适宜的湿度，可避免因湿度大、空气污浊诱发大肠杆菌病。控制温度同时添加药物预防，可用头孢类药物，如头孢曲松每克加水10～20kg，连用3d。或者和氧氟加替联合应用。
2、21～35日龄
这一阶段是鸡大肠杆菌病的高发阶段。饲养管理上要求温度控制在24℃左右，进一步加强通风，添加药物预防大肠杆菌病，还应注意添加抗球虫病药物预防球虫。预防大肠杆菌病可采用氨基糖苷和林克霉素类联合应用。
如阿米卡星饮水，1g阿米卡星加水20kg，连用3d。加上林可霉素1g兑水10kg。抗球虫药可用地克珠利饮水或用三字球虫粉全天量1次饮水，既可防大肠杆菌病又可防球虫病，此阶段成果亦可维持半个月左右。
3、35～55日龄
此阶段易发生大肠杆菌性关节炎及大肠杆菌性肠炎，采用左旋氧氟沙星全群饮水，15g5左旋氧氟沙星加水200kg，并配合林克霉素连用3～5d。即可控制大肠杆菌病，也可控制慢性呼吸道病。
此外，大杆感染部分来源于不洁的饮水，因此定期对饮水系统进行消毒，带鸡消毒非常关键。国内部分专家不提倡对鸡群进行带鸡消毒，认为可能会导致肠道菌群失调，或者会对肠粘膜造成损伤，个人认为这个担心并不存在。做为人用饮用自来水都含一定浓度的漂白粉，何况鸡呢?只要浓度控制好即可。
常见大杆药物
一、β-内酰胺类抗生素
1、青霉素类。
用法与用量：
⑴氨苄西林：内服一次量为每千克体重10毫克或肌注为一次量每千克体重10毫克，1日2-3次。
⑵阿莫西林：内服一次量为每千克体重10-15毫克，1日2次。
2、头孢菌素类。临床上应用的有头孢噻呋、头孢噻肟、头孢唑肟、头孢曲松、头孢哌酮、头孢他啶、头孢吡肟。该类药物内服吸收并不好不建议进行口服给药。
用法与用量：头孢噻呋、曲松、噻污：1日龄肉鸡肌注每千克体重为2.2-5mg.
3、β-内酰胺酶抑制剂。目前兽医临床上使用的β-内酰胺酶抑制剂有克拉维酸和舒巴坦。
用法与用量：
⑴阿莫西林+克拉维酸钾(2:1)：内服一次量每千克体重10-15毫克(以阿莫西林计)，1日2次。
⑵氨苄西林钠+舒巴坦钠(效价比2:1)：肌注一次量每千克体重10毫克(以氨苄西林计)，1日2次。
以上药物临床讲严格属于一日多次用药，长时间投服，但是下面老百姓饮水系统不好保证，因此建议集中饮用，缩短给药时间，以免外界酶系统对本类药物的破坏。
二、氨基糖苷类
本类药物内服吸收很少，几乎完全从粪便排出，可用作肠道感染用药，肌注给药后吸收迅速，大部分以原形从尿中排出。由于该类药物内服吸收很少，用于大肠杆菌败血症治疗须用肌注给药，不便于禽的群体用药。本类药物兽医临床上常用的有链霉素、庆大霉素、丁胺卡那霉素、新霉素、大观霉素、安普霉素。 用法与用量：
⑴硫酸丁胺卡那霉素：肌注一次量每千克体重5-7.5毫克。
⑵盐酸大观霉素：混饮每1升水500-1000毫克(效价)，连用3-5天。
⑶硫酸安普霉素混饮每升水250-500毫克(效价)，连用5天。
⑷硫酸新霉素：混饮每1升水35-70毫克(效价)，连用3-5天。
以上药物需要集中给药，不适合全身感染状况。以不中毒为限。在碱性条件下药效比酸性好。
三、四环素类
用法与用量：盐酸多西环素混饮每升水50-100毫克。
该类药物有一定免疫调节作用，不稳定，因此建议集中给药，酸性条件下药效更好。
四、氯霉素类
氯霉素因抑制骨髓造血机能而禁止使用于所有食品动物。其他药物特点是抗菌谱广、吸收良好、体内分布广泛，无潜在致再生障碍性贫血作用。
用法与用量：
⑴甲砜霉素。内服一次量每千克体重20-30毫克，1日2次，连用3-5天。
⑵氟甲砜霉素。内服一次量每千克体重20-30毫克，1日2次，连用3-5天。肌肉注射一次量每千克体重20毫克。
五、氟喹诺酮类
在兽医临床应用的有：氟甲喹、诺氟沙星、培氟沙星、氧氟沙星、环丙沙星、洛美沙星、恩诺沙星、达氟沙星、二氟沙星、沙拉沙星、麻保沙星等。
用法与用量：
⑴诺氟沙星：混饮每升水100毫克。
⑵环丙沙星：混饮每升水50毫克。肌肉注射每千克5毫克体重，1日2次。
⑶恩诺沙星：混饮每升水50-75毫克
六、抗菌中草药
中草药的抗菌作用一方面通过中草药中含有抗菌物质如小檗碱、大蒜素、大黄、鱼腥草素等植物杀菌素直接作用于微生物，另一方面通过调动机体的免疫系统来杀灭微生物。
常见的有穿心莲、黄芩等。常见复方为，四味穿心莲散、白头翁散、四黄消炎散等。
