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第一，追风作秀的成分为主导。很多连锁店经营者在对连锁加盟的实质不了解的情况下，就匆忙建连锁店。看到其它行业建了连锁店，自己也模仿建店。挂上连锁店牌子，就宣传建了多少家连锁店，来扩大自己的知名度。个别医药公司对连锁店心不在焉，目的是制造概念来圈钱。
第二，享受单一资源，无规范运作。大多数所谓连锁店只是共享了供货资源，即你卖什么药品我也可以卖什么药品。无资本纽带，不能做到统一财务、统一店面标识、统一信息服务、统一文化内涵、统一操作管理。
第三，生产企业挂连锁店牌子，流通企业搞子母店。生产企业给经销商安装连锁店门面牌目的是卖自己的产品，宣传自己的企业。如“××医药连锁店”，其实店里只有几个产品是本企业的，其它方面全无任何关系，这与其叫连锁店，不如叫直营店。流通企业在本地区规模大了以后，想到其它地方开几家销售点，就挂上“××连锁店”，同样也只是牌子而已，是原来销售店外延的扩大，全无连锁店的内涵。
第四，只做批发业务，未做终端。连锁超市的本质特征是零售店，但目前具备开连锁店能力的经销商多半是靠批发产品发展起来，他们所开的连锁店很难跨越批发分销业务门槛，这样便失去了连锁店的意义。
第五，虽然医药企业中三精、海王、哈药等企业已建成近1000家连锁店。但真正跨区域、上规模的连锁药店普遍罕见，小打小闹难成气候。
医药行业连锁店、加盟店、特许店、会员店等新型营销模式，其先进性和生命力是不容置疑的。它通过股份制和特许经营等组建跨地区、跨部门、跨所有制的综合农资联合体，采用统一标识、统一品牌、统一管理、统一服务、统一经营各种品牌的医药器械、药品以及其它涉医商品；通过优势互补，统筹规划，集采购、储运、配送、零售、服务为一体，直接面对消费者，可较好杜绝假冒伪劣产品，减少中间环节和费用，让患者从中得到实惠。入世后虽然允许跨国公司建立自己的网络，但他们对此并不感兴趣，这不能不引起我们的思索。医药连锁店在战略上的可行性与战术上的可操作性上，都需要我们认真地对待。在我国大规模建立连锁店、加盟店、会员店，目前至少存在着以下5道门槛：
门槛之一，我国有近八亿农民，他们所居住的地点高度分散。因此，农民购买药品不可能舍近求远到连锁店去。连锁店密度高的话，一次性投入大，运行成本高；若密度低的话，则覆盖面不足。
门槛之二，经营品种与需求问题。我国人口众多，不同地区所发生的疾病和用药方式各不相同。因此，药品需求差异性很大，给产品的统一采购带来了难度。也就出现了甲店的品种不一定适合乙店，乙店的品种不一定适合丙店。所以要想使甲乙丙都适合，就必须加大品种采购量，这样就会造成浪费。若采购量不足的话，又会因经营品种单一而提高成本影响利润。
门槛之三，运行成本问题。目前所有生产商与经销商合作都是建立在利益基础上的。流通企业靠批发形成了自己的赢利模式，若延伸到终端连锁的话，是否因成本增加而失去了自己的优势？连锁店的成本包括采购、配送、人员、服务4个主要部分。而目前中小城市的居民所居住的社区分散，统一采购、统一配送肯定会增加费用成本；网点密集则会因人员多、服务工作量大而增加费用成本。医药行业自己建连锁店的话，若经营品种太少难以承担运行成本；若与经销商联合组建连锁店，则是纸上谈兵。
门槛之四，医药市场不规范问题。目前，医药市场供求失衡，管理混乱，好卖的产品不赚钱，赚钱的产品不好卖。你的连锁店不赢利便罢，若赢利了便会有不正当竞争出现，叫你难以生存，有时甚至跨掉。因而，在目前医药市场不规范的大环境下，只有共同赢利才能生存。
门槛之五，服务一体化问题。据了解，西方发达国家医药经营公司与中国的零售店同类型的几乎没有。他们将医药的销售、患者用药与医疗技术服务融为一体，单独卖药品的很少。近几年来，随着人们生活水平的提高，健康意识有了根本性的转变，对药品的售后服务有了更高的要求。医药连锁店对此恐怕是难施拳脚，它与目前国内的消费观念难以融合。
