爱华网当时段永基在管理和经营企业方面，也有很多创举。例如在国际化方面，段永基做得最早，动静也最大。他率先提出了办企业也要“站在巨人肩膀上”，与“巨人同行”。
1993年，四通与松下合作，成立四通松下电工。同一年，段永基还成功与美国的康柏联姻，康柏作为美国PC行业的新星，正极力拓展全球市场，四通及时伸出橄榄枝，成为康柏电脑中国区总代理。次年四通又与康柏合资成立康柏(中国)有限公司，虽然只占股10%，但成为康柏全球25家公司中惟一一家合资公司。之后，四通与康柏的关系逐年深化。
在前期成功的基础上，段永基拉来的巨人越来越多，越来越广。从美国的微软、康柏，到日本的松下、三井、三菱，不一而足。据统计，四通正式牵手过的外资企业仅日本就有12家，美国就有5家，而且相对集中在IT、电子、通信等高科技领域。
在把这些巨头领进中国的同时，四通本身也得到了切实的利益。这种利益不仅仅体现为引进技术和管理，还实实在在表现为产品销售利润与出口分成。段永基后来在出席某些场合的聚会时坦陈，四通的不少合资项目取得了15倍的回报。
段永基还主持设计了四通的两次中国式MBO，创造性地设立了员工持股会，解决了四通的产权归属问题，这至今仍然是不少中国企业家解决国有或集体所有制企业产权问题，必然会参考的一个经典案例。
在产业化方面，段永基也具备远见卓识。
除打印机领域之外，四通又试图开辟激光照排、金税工程等系列产品，既要避免产品过于单一，又要避免产业过于多元化。
然而，也许是过于超前，过于担心成为先烈等原因，四通步步都踩到了点上，但一步也没踩踏实。电脑代理成就了联想，激光照排成就了方正，税控打印机最后花落多家。段永基1999年被北京市政府“钦点”，出任上市国企中关村科技的总裁。他为中关村科技选择的CDMA、歌华数据、电子政务、中广有线等业务，也都是浅尝辄止，不是画饼充饥，就是虎头蛇尾。
1997年之后的十多年时间里，四通竟然在产品、销售、渠道、网络、品牌、技术等各个方面都毫无建树，这期间套在明星企业家段永基头上的光环也越来越暗淡，外界对于他的负面评论也越来越多。
有评论认为，段永基是一个错位的企业家。段永基悲剧的根源在于，他总是坐在民营公司的椅子上，打着政府的算盘，公司只有10亿元的规模，他却天天谋划着1000亿元的产业。
晚年的段永基似乎也意识到了这一点。2003年，在四通电子以11.7亿港元收购史玉柱旗下的脑白金和黄金搭档时，媒体质疑这两个产品已经老化，段永基是在替史玉柱套现。段永基对此解释说，四通这些年的衰落，很大程度上源于客户定位有问题，过去的四通一直瞄准政府和企业，始终没有面对13亿消费者，这是四通最大的失误，收购脑白金和黄金搭档，恰好可以弥补四通在这些方面的不足。
然而无论是牵手史玉柱买保健品，还是拉着黄光裕等大佬投资房地产，都没有能让段永基重获生机，段永基近几年带领旗下的公司左冲右突，仍然是毫无建树，反而更像是回光返照。到2005年，四通系不是爆出企业亏损的新闻，就是传出段永基被审计、双规和罚款的猛料，段永基不可避免地从明星走向了平庸。
勉强的“完美谢幕”
尽管经历了多次的沉浮，但段永基在中关村的地位一直难以撼动。他在四通集团董事长的席位上足足坐了17年，全面掌控中关村科技的时间超过8年，而新浪从其前身四通利方至今，只有16年的历史，也一直在段永基的掌控当中。
新浪堪称是段永基晚期最值得一提的投资。1993年12月，以王志东为首的创业团队接受了四通集团500万港币的投资，创办了四通利方，由四通持有80%的股份。从1997年到1999年，新浪网由四通利方脱胎而出并完成了3轮融资。不过，随着频繁融资，四通集团的股权也被多次稀释。
为了削弱创业团队以及管理层的权利，2001年，段永基通过董事会成功将王志东逐出新浪，创业家与资本之间是否水火不容的深刻话题由此产生。同年，为了进一步控制新浪董事会，由段永基牵头，吴征杨澜夫妇以29%的阳光权益换取790万美元现金和10%新浪股权以及6%的期权。随后，段永基又与吴征合资成立阳光四通。通过这些合作，段永基如愿获得了新浪20.6%的股权，又一次增强了对新浪的控制，为其长期担任新浪董事长奠定基础。
段永基担任新浪董事长期间，新浪走马灯似的换CEO，十年中共换了五任CEO，依次是沙正治、王志东、茅道临、汪延和曹国伟。据说，这些CEO变换的幕后，都贯穿了段永基的意志。
不可避免的是，在这些人事变换的游戏过程当中，新浪除了网络新闻始终保持了中国互联网媒体第一品牌的地位之外，在互联网游戏、无线增值业务、城市频道等方面，都一一被竞争对手超越。给新浪带来压力的，不仅仅有老对手网易和搜狐，还包括后起之秀百度、盛大和腾讯等。
新浪在诸多领域落败之后，段永基已经不再认为新浪是最有价值的投资了。自2003年以后，他就开始减持新浪的股票。资料显示，在2003年2月至2004年2月的一年时间里，作为新浪前最大股东的四通电子先后15次在纳斯克达抛售新浪股票，共获得1.47亿美元现金。段永基曾经无情地在公开场合宣称，他投资新浪的目的就是为了获利。
所以当新浪方面宣布，段永基辞职，新浪副董事长汪延出任代理董事长一职，对于这一人事变动，外界普遍认为对于新浪而言，这是一个利好消息。
一位资深业内人士告诉记者，“段永基在这个节点上离开，理由很简单，新浪本来就是段永基无心插柳的一个项目，然而这个项目却为其带来了丰厚的收益，作为一个投资人，资本与收益到了一定比例的时候转身离去很正常。”
也有人认为，段永基早就应该辞职，互联网公司的核心管理者还是应该以互联网为事业的人来担任，而不应该是段永基这样的投资界人士，业界普遍希望这次高层人士变动能够为新浪的经营带来转机。
段永基大概也没有想到，在他撤离新浪，决定归隐的时候，会有那么多人叫好。段永基和柳传志是相交多年的老朋友。1995年，在联想需要资金的时候，段永基力排众议为联想的4亿元贷款做了担保。对此，柳传志深为感激，后来在四通业绩不景气的时候，柳传志也不吝援手，帮助四通获得了巨额贷款，度过了难关。事实上，柳传志早就评论过老朋友段永基：“他永远踩在时代的节点上，不断转型、与时俱进，但能不能完美谢幕就很难说了。”
柳传志的言下之意可以理解为，段永基如果再折腾下去，有可能会像牟其中、顾雏军等人一样，身陷囹圄，以不得已的方式结束自己的企业家生涯。因此当段永基离开中关村科技，然后又以比较体面的方式离开新浪之后，外界普遍认为这勉强可以看成是一次“完美谢幕”。
