爱华网针对个别地市党政领导干部所谓国务院办公厅关于规范国企改制工作的意见“束缚了地方的手脚”，3号令执行“太麻烦”的责难，他奋起批驳，并且将执不执行3号令、加不加强国有产权监管，上升到能否巩固执政党地位的高度来认识。2004年9月，在十六届四中全会闭幕当日，他就写出了《从加强党的执政能力建设的高度进一步提高做好国有产权管理工作重要性的认识》文章，其中特别讲到俄罗斯和原东欧社会主义国家在改革过程中国有资产大量流失，从而动摇了执政党地位的前车之鉴，以此警示全党。这篇文章被新浪网转载后，得到广泛认同。
何亚斌除了借鉴国外教训外,还借古喻今。2004年春节期间，他重读《红楼梦》，写出了《从贾府的衰败看公有资产监管》一文，在《上海国资》发表后，社会好评如潮，成为引用率很高的文章。 3号令实施一年后，何亚斌总结出，执行3号令的阻力来自内部人控制。他写出了《中国产权市场发展的最大风险来自于转让方内部人控制》，在厦门“产权市场发展与风险防范研讨会”上演讲，对如何控制内部人控制提出了实际的对策，引起了与会人员的共鸣，听众多次自发热烈鼓掌。 3号令实施两年后，何亚斌在接受新浪网采访时态度坚决地强调，“解决中国产权市场规范和发展的途径，第一是全面落实3号令，第二是深入落实3号令，第三是长期落实3号令。舍此别无他途！” 2004年,他利用8个月的夜间，写出了32万字的专著《产权交易新工具》，当年10月由华中科技大学出版社出版，颇受产权界人士的推崇，著名产权经济学家常修泽称赞这是“一部实用且有新意的产权交易著作”，并写出书评在《长江日报》推荐。 何亚斌的许多观点被后来的实践证明是正确的，因而为业界同仁所赞佩。 ——他率先提出资本与人的配置问题。他认为，产权交易的根本目的不仅仅为了防止国有资产流失，而应着眼于资源有效配置。而资源配置不仅是经济布局和结构的调整，还应是产业的重组，是人与资本的重组。他提出，产权交易不仅仅是要实现资本规模的扩大和资本结构的改善，而且要实现经济资本与优质人力资本特别是优秀企业家的最佳结合。他这个观点在1999年4月硕士论文中提出时，即为武汉大学、华中科技大学的博导所赞赏。这些观点随后在《中国信息报》、《国有资产管理》、《湖北日报》上发表。在实践中，他主持湖北省产权交易中心创造出“评审加竞价”的方式来应用这一理论。“评审”就是对同一标的意向受让方评审，找出几个优秀的意向受让方，特别是优秀企业家；“竞价”就是在同是合格的受让方之间竞价。在这里，他们把找到优质人力资本放到竞价的前面。——他正确论述了国有资产流失与保值问题。他提到，邓小平说过“既要反右，又要反左”，中国产权交易同样既要反右,又要反左。他认为,中国目前的资产评估方法大多采用“重置成本法”，极少采用“未来收益法”，很不科学。加之评估机构和评估人员素质悬殊，因此评估报告无论是从理论上讲还是从现实上讲，都只能作为交易的参考。死守评估报告是可笑的;交易价低于评估价就是“流失”，高于评估价就是“增值”的观点因之也是可笑的。何亚斌认为，充分的竞争市场才是发现价格的唯一场所。既要反对不顾评估结果，恶意造成国有资产流失的行为，又要反对自冠国有资产“卫道士”，动辄以评估值为标准指责国有资产流失的言论。解决这个问题的唯一办法,是让国有产权进入省级以上国资委选择确定的产权交易机构内规范操作。由此则一切“反恻自消”。
——他在中国产权界第一个提出了不良资产证券化问题。他运用美国不良资产证券化的先锋理论，写出了《不良资产证券化:产权交易业务的创新》和《从资产证券化中寻找大商机——再论产权交易业务创新》，受到北京大学一位经济学教授的赞许。 ——他坚决反对企业改制中的急性病。何亚斌认为，中国国有企业经过了50多年的塑造，很多问题已积重难返，对这样的企业实施改革，既不能拖下去，也不能采取俄罗斯的“休克疗法”，必须一厂一策，反复研究，切忌“急性病”。有些地方党政领导强行规定把本地国有企业一个月、半个月甚至一周内全部改制完，把50年积累的问题用5天时间解决，这怎么可能呢！许多国有企业改制弄虚作假，只好“二次改制”、“三次改制”就是明证。 在产权业界，何亚斌是有名的笔杆子，他坚持做到“文必己出”。大气、有思想是其文章的一贯特点。正是郑板桥的风格，“直抒血性为文章”。 何亚斌为人谦恭，注意学习别人的先进思想和成功做法，并利用一切机会宣传兄弟省市的经验,推进产权市场共同发展。他在业界公开场合宣传过江西大力整合产权市场的经验，福建利用产权引进外资的经验，河北股权托管的经验，黑龙江基础管理的经验，江苏业务开拓的经验,广州市场配置的经验，上海、天津、北京机制灵活和工作有为的全面经验等等。他很崇尚唐代杨敬之诗句:“平生不解藏人善，到处逢人说项斯”。
何亚斌不仅思想活跃并且比较深邃，更是一位务实的实干家。
2005年，是何亚斌从事产权事业以来最为舒心的一年。在湖北省国资委的领导和支持下，以“五统一”为旗帜，整合湖北市场，将产权市场做大做强的思路得以初露端倪。湖北目前形成了以省产权交易中心为龙头，9个分中心为节点，以产权交易为主业、股权托管为补充的初步统一的市场体系，为建成区域性产权交易市场奠定了良好的基础。
