爱华网新医改配套方案即将出台，市场预期医药行业将因此迎来一轮大发展，也将促使医药流通企业加速整合。中投顾问医药行业研究部分析师许玲妮认为，生产企业直接投标而不是由流通企业投标，将引发医药流通企业的洗牌和淘汰。
许玲妮指出，由于生产企业直接面对终端的政策规制，客观上加强了生产企业在与流通企业博弈中的优势，提高了生产企业在药品流通中的地位；而流通企业处于夹缝中生存的状态，在博弈中的地位将会下降。流通中间环节将大幅减少，使得药品流通市场份额将大幅压缩。流通企业惟一的出路就是做大做强，成为生产企业不得不依靠、医疗机构不得不利用的中间环节。在这个阶段，流通企业的洗牌和淘汰将进一步加剧。资金雄厚的大企业必将大力扩张、拓展渠道，而小企业被生产厂家选为配送企业的几率极小，可能面临被淘汰的命运。
有业内人士断言，医改后，至少20%的医药流通企业将倒闭，市场也有望快速集中到几大医药流通企业龙头手中。
2009年1月，卫生部等六部委已经联合出台《关于进一步规范医疗机构药品集中采购工作的意见》(简称《意见》)，在该《意见》中明确提出，全面实行政府主导、以省(自治区、直辖市)为单位的网上药品集中采购工作。《意见》中还提到，在招标过程中，药品集中采购由批发企业投标改为药品生产企业直接投标。显然，按照最新的政策，在负责招标的部分，流通企业被排除在外，而招标完成后，从生产企业到医疗机构，中间只能经过一家配送企业。以往，从医药生产企业到医疗机构，中间的环节一般都在三四个环节以上，层层分销是药价虚高的一个重要原因。
2009年3月13日正式发布的《物流业调整和振兴规划》中就明确提出：实行医药集中采购和统一配送，推动医药物流发展。值得注意的是，医药物流第一次明确作为物流业的分支在全国性的正式文件中提出。长期以来，我国蓬勃发展的医药物流业受制于我国基础物流业发展的滞后，产生了货物配送难、农村市场开发难、特殊药品配送质量难以保证等许多让企业头疼的问题。此次振兴物流业的工程如能有效实施，必将明显促进医药物流业的发展。
据悉，医药流通企业的巨头已经开始布局全国。2009年2月，国内医药流通领域排名第一的国药集团复星医药向国药投资有限公司注资6亿元，以构建其在全国的分销网络。
而国内最大的民营医药商业企业九州通集团，也正加紧布局全国。九州通集团计划在全国范围内逐步建立15家子公司、100家二级配送中心、5000家连锁零售店。
上海医药2月26日发布公告称，公司决定投资4500万元以川桥路1065号地块为基础建设上海医药现代物流中心浦东分中心。
